共收集评论文章九十九篇，上卷为经络脏腑、脉、病、方药，下卷则治法、书论（并各科）、古今。
全书共43篇，阐述病因、病理、诊治要则、用药及辨药大略。作者学验俱中，其理论宗法《内经》、《难经》与《伤寒论》又兼采诸家之长。善于辨别疑似之证，力究疾病原委，治病反对拘泥成方，论述简要切实。
卷一至九为“阴阳脏腑部”，卷十至二十九介绍各脏腑有关病证治，卷三十至三十三为伤寒部，卷三十四至三十五为妇人部，卷三十六至三十九为小儿部，卷四十为运气部。
书中收录了大量的病例及方剂，以及张锡纯先生的评点文章。全书载案逾千,轻浅之病记载稍略,重病、久病或专示病案者,观察记载无不详细贴切,首尾完整。
首先列出生理上脏腑、经络的体和用，以及四诊概要，而后归纳了许多证治，提纲挈领，辨证简要，用药平正，使读者记诵、思维，易于掌握辨证施治的大法，不致茫无所措。
全书共分86个标题，涉及中医基础、诊断、辨证、治法、方药、病证、针灸、五运六气、医籍校勘正误析疑以及医家述评等多方面的内容。
卷一医学总论，论述阴阳、脏腑、诊法等；卷二-三介绍伤寒、瘟疫、内科杂病、妇产、小儿及疮症；卷四医案、十四经脉图及经穴歌、程钟龄医门八法等。
分八卷，卷一至卷三为“四明心法”，卷四为“四明医案”，卷五“东庄医案”为吕用晦临床治验笔记，卷六至卷八为“西塘感证”。
全书分15篇，共90卷。其中《伤寒》、《金匮》两篇集各家注解之大成，其他各篇则以歌诀形式，内容涉及内、外、妇、儿、眼、针灸、正骨等各科的辨证治疗，图文并茂，并汇集了大量方剂。
前二卷以辨析伤寒及伤寒诸证为主，兼论多种温病，俾伤寒温病之辨当有所遵循。并补入《温热论》；卷三列述阴阳升降之理，切脉审证之要；书末附方80首。
为历史上第一部方论专著，收集历代常用方700余首，按病症分为中风、伤寒、感冒、暑湿、瘟疫等44类，每类下集同类方若干首，揆之于经，酌以己见，订之于证，发其微义，对各方阐明其组成、方义、功用及药物配伍。
本书系根据汪昂《医方集解》中的方剂次序，删去原书各方的主治与注文，然后逐方予以评述。
本书内容涉及太极图抄引、太极图说、不知《易》者不足以言太医论 、问三才所同者于人身何以见之、命门图说、右肾水火辩、七节之旁中有小心、问诊三焦包络、脉义、问手心主等。
此书杂录各有关医药典故，并予述说，演成此帙。在杂谈自然、物理现象及释医中，虽然搜集了较多放失旧闻，但也掺杂了一些糟粕性内容。
全书分上、下两卷。作者通过数十年对人体结构的观察研究，纠正了前人关于脏腑记载的一些错误。
以讨论杂病和常见病症为题目，辨明内外虚实、经方时方之要，再结合时弊详加论说，颇切临床实用。
以元阴、元阳为人身立命之本立论，阐明治病分阴阳、辨虚实，探求乾坤坎离大旨，论阴阳之盈缩、生化之至理、用方用法圆通之妙义，释明“发病损伤各有不同，总以阴阳二字为主，阴盛则阳必衰，阳盛则阴必弱，不易之理也”。
全书共7卷，前4卷除卷一开头有部分基础理论内容外，主要阐述内科杂症的病因病机、辨证诊断及治疗方法，卷五论述四诊，最后两卷是方药 。
作者十分推崇张景岳，故主要参酌《类经》中的注释，也吸收了其它各家学说。书中共分摄生、阴阳、藏象、脉色、经络、标本、气味、论治和疾病等类，共14篇。
尝谓吴陵刘氏纯所辑玉机微义以发明之。复采集名论为初教之资也。并刻之。名曰医经国小。以传其书。首本草。次脉诀。次经络。次病机。次治法。次运气。凡六卷。
