本草崇原

此书摘录《本草纲目》中本经药233味，(另有附品56种)，作“崇原”之论，药分上中下三品，从药物性味、生成、阴阳五行属性、形色等入手，结合主治疾病之机理，阐明功效，崇本求原思想。

侣山堂类辩

上卷大多采用问答的形式杂论医理，对脏腑功能、病原、病症、病种、证治、方剂等内容分题予以辨析，说理简明扼要。书中作者以严肃的态度对古医书和医家谬误之说颇多纠正，对六经和脏腑的功能有所发挥。下卷主要阐述药性和方剂配伍。