将《灵枢》、《素问》分作十二大类，三百九十节，共计三十二卷，全书多从易理，五运六气、脏腑阴阳气血的理论来阐发经文蕴义，颇能启迪后人，深为后世所推崇。
全书分为传忠录、脉神章、伤寒典、杂证谟、妇人规、小儿则、痘疹诠、外科钤、本草正、新方八略、新方八阵、古方八阵、妇人规古方、小儿则古方、痘疹诠古方、外科钤古方等16种。
共收医论四十五篇，专就金、元诸家论医的偏执处“辨论之，以正其失”故题曰“质疑录”。全书重点论述多种病证的治则，在其重阳气学术思想指引下，进一步发挥了温补学说。
内容共分总论、经脉、胎孕、产育、产后、带浊梦遗、乳病、子嗣、症瘕及前阴10类，依据妇女生理特点和病变规律，论述妇科诊治法则。
