金匮钩玄

全书共3卷，并附医论6篇。卷一、卷二为内科、喉科和外科病症，卷三为妇科、儿科病症。

丹溪心法

五卷。 分 100 门，包括外感、内伤、外证、妇科、幼科等，前有十二 证见证等六篇，后附“丹溪翁传”。

丹溪治法心要

全书共八卷，分列一百五十四证，包括内、外、五官、妇人、小儿等各科疾病，每种疾病，均详述其病因、证治，以及个人独到的临证经验。

格致余论

因“古人以医为吾儒格物致知一事”而得名。为朱氏的医论集，其著名的“相火论”“阳有余阴不足论”等俱载于此书，集中反映了朱氏的学术观点，阐述了相火与人身的关系。